對(duì)于醫(yī)學(xué)生來(lái)說(shuō),進(jìn)行醫(yī)學(xué)英語(yǔ)學(xué)習(xí)是非常有必要的,因?yàn)樵诠ぷ髦袝?huì)涉及到很多國(guó)內(nèi)外的最新醫(yī)學(xué)信息。下面是小編整理的《生物化學(xué)》名詞解釋總結(jié)的資料,希望對(duì)你有所幫助!
《生物化學(xué)》名詞解釋總結(jié)
氨基酸(amino acids):
是含有一個(gè)堿性氨基和一個(gè)酸性羧基的有機(jī)化合物,氨基一般連接在α-碳上。氨基酸是肽和蛋白質(zhì)的構(gòu)件分子。
必需氨基酸(essential amino acids):
指人(或其它脊椎動(dòng)物)自己不能合成,需要從飲食中獲得的氨基酸,例如賴氨酸、蘇氨酸等氨基酸。
非必需氨基酸(nonessential amino acids):
指人(或其它脊椎動(dòng)物)自己能由簡(jiǎn)單的前體合成的,不需要由飲食供給的氨基酸,例如甘氨酸、丙氨酸等氨基酸。
等電點(diǎn)(pI,isoelectric point):
使分子處于兼性分子狀態(tài),在電場(chǎng)中不遷移(分子的凈電荷為零)的pH值。
茚三酮反應(yīng)(ninhydrin reaction):
在加熱條件下,氨基酸或肽與茚三酮反應(yīng)生成紫色(與脯氨酸反應(yīng)生成黃色)化合物的反應(yīng)。
肽鍵(peptide bond):
一個(gè)氨基酸的羧基與另一個(gè)氨基酸的氨基縮合,除去一分子水形成的酰胺鍵。
肽(peptides):
兩個(gè)或兩個(gè)以上氨基酸通過(guò)肽鍵共價(jià)連接形成的聚合物。
蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)(primary structure):
指蛋白質(zhì)中共價(jià)連接的氨基酸殘基的排列順序。
層析(chromatography):
按照在移動(dòng)相(可以是氣體或液體)和固定相(可以是液體或固體)之間的分配比例將混合成分分開的技術(shù)。
離子交換層析(ion-exchange column chromatography):
使用帶有固定的帶電基團(tuán)的聚合樹脂或凝膠層析柱分離離子化合物的層析方法。
透析(dialysis):
通過(guò)小分子經(jīng)半透膜擴(kuò)散到水(或緩沖液)的原理將小分子與生物大分子分開的一種分離純化技術(shù)。
凝膠過(guò)濾層析(gel filtration chromatography):
也叫做分子排阻層析(molecular-exclusion chromatography)。一種利用帶孔凝膠珠作基質(zhì),按照分子大小分離蛋白質(zhì)或其它分子混合物的層析技術(shù)。
親和層析(affinity chromatography):
利用共價(jià)連接有特異配體的層析介質(zhì)分離蛋白質(zhì)混合物中能特異結(jié)合配體的目的蛋白或其它分子的層析技術(shù)。
高壓液相層析(HPLC,high-pressure liquid chromatography):
使用顆粒極細(xì)的介質(zhì),在高壓下分離蛋白質(zhì)或其它分子混合物的層析技術(shù)。
凝膠電泳(gel electrophoresis):
以凝膠為介質(zhì),在電場(chǎng)作用下分離蛋白質(zhì)或核酸等分子的分離純化技術(shù)。
SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳:
(SDS-PAGE,sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrohoresis)
在有去污劑十二烷基硫酸鈉存在下的聚丙烯酰胺凝膠電泳。SDS-PAGE只是按照分子大小分離的,而不是根據(jù)分子所帶的電荷和大小分離的。
等電聚焦電泳(IFE,isoelectric focusing electrophoresis):
利用特殊的一種緩沖液(兩性電解質(zhì))在聚丙烯酰胺凝膠內(nèi)制造一個(gè)pH梯度,電泳時(shí)每種蛋白質(zhì)就將遷移到它的等電點(diǎn)(pI)處,即梯度中的某一pH時(shí),就不再帶有凈的正或負(fù)電荷了。
雙向電泳(two-dimensional electrophoresis):
是等電聚焦電泳和SDS-PAGE的組合,即先進(jìn)行等電聚焦電泳(按照pI分離),然后再進(jìn)行SDS-PAGE(按照分子大小),經(jīng)染色得到的電泳圖是個(gè)二維分布的蛋白質(zhì)圖。
Edman降解(Edman degradation):
從多肽鏈游離的N末端測(cè)定氨基酸殘基的序列的過(guò)程。N末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯修飾,然后從多肽鏈上切下修飾的殘基,再經(jīng)層析鑒定,余下的多肽鏈(少了一個(gè)殘基)被回收再進(jìn)行下一輪降解循環(huán)。
同源蛋白質(zhì)(homologous proteins):
來(lái)自不同種類生物、而序列和功能類似的蛋白質(zhì)。例如血紅蛋白。
構(gòu)型(configuration):
一個(gè)有機(jī)分子中各個(gè)原子特有的固定的空間排列。這種排列不經(jīng)過(guò)共價(jià)鍵的斷裂和重新形成是不會(huì)改變的。構(gòu)型的改變往往使分子的光學(xué)活性發(fā)生變化。
構(gòu)象(conformation):
指一個(gè)分子中,不改變共價(jià)鍵結(jié)構(gòu),僅單鍵周圍的原子旋轉(zhuǎn)所產(chǎn)生的原子的空間排布。一種構(gòu)象改變?yōu)榱硪环N構(gòu)象時(shí),不要求共價(jià)鍵的斷裂和重新形成。構(gòu)象改變不會(huì)改變分子的光學(xué)活性。
肽單位(peptide unit):
又稱之肽基(peptide group),是肽鏈主鏈上的重復(fù)結(jié)構(gòu)。是由參與肽鍵形成的氮原子和碳原子和它們的4個(gè)取代成分:羰基氧原子、酰胺氫原子和兩個(gè)相鄰的α-碳原子組成的一個(gè)平面單位。
蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)(protein secondary structure):
在蛋白質(zhì)分子中的局部區(qū)域內(nèi)氨基酸殘基的有規(guī)則的排列,常見的二級(jí)結(jié)構(gòu)有α-螺旋和β-折疊。二級(jí)結(jié)構(gòu)是通過(guò)骨架上的羰基和酰胺基團(tuán)之間形成的氫鍵維持的。
蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)(protein tertiary structure):
蛋白質(zhì)分子處于它的天然折疊狀態(tài)的三維構(gòu)象。三級(jí)結(jié)構(gòu)是在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進(jìn)一步盤繞、折疊形成的。三級(jí)結(jié)構(gòu)主要是靠氨基酸側(cè)鏈之間的疏水相互作用、氫鍵范德華力和鹽鍵(靜電作用力)維持的。
蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu)(quaternary structure):
多亞基蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)。實(shí)際上是具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈(亞基)以適當(dāng)方式聚合所呈現(xiàn)出的三維結(jié)構(gòu)。
α-螺旋(α-helix):
蛋白質(zhì)中常見的一種二級(jí)結(jié)構(gòu),肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結(jié)構(gòu),螺旋是靠鏈內(nèi)氫鍵維持的。每個(gè)氨基酸殘基(第n個(gè))的羰基氧與多肽鏈C端方向的第4個(gè)殘基(第n+4個(gè))的酰胺氮形成氫鍵。在典型的右手α-螺旋結(jié)構(gòu)中,螺距為0.54nm,每一圈含有3.6個(gè)氨基酸殘基,每個(gè)殘基沿著螺旋的長(zhǎng)軸上升0.15nm.β-折疊(β-sheet):
是蛋白質(zhì)中的常見的二級(jí)結(jié)構(gòu),是由伸展的多肽鏈組成的。折疊片的構(gòu)象是通過(guò)一個(gè)肽鍵的羰基氧和位于同一個(gè)肽鏈或相鄰肽鏈的另一個(gè)酰胺氫之間形成的氫鍵維持的。氫鍵幾乎都垂直伸展的肽鏈,這些肽鏈可以是平行排列(走向都是由N到C方向);或者是反平行排列(肽鏈反向排列)。
β-轉(zhuǎn)角(β-turn):
也是多肽鏈中常見的二級(jí)結(jié)構(gòu),連接蛋白質(zhì)分子中的二級(jí)結(jié)構(gòu)(α-螺旋和β-折疊),使肽鏈走向改變的一種非重復(fù)多肽區(qū),一般含有2~16個(gè)氨基酸殘基。含有5個(gè)氨基酸殘基以上的轉(zhuǎn)角又常稱之環(huán)(loops)。常見的轉(zhuǎn)角含有4個(gè)氨基酸殘基,有兩種類型。轉(zhuǎn)角I的特點(diǎn)是:第1個(gè)氨基酸殘基羰基氧與第4個(gè)殘基的酰胺氮之間形成氫鍵;轉(zhuǎn)角II的第3個(gè)殘基往往是甘氨酸。這兩種轉(zhuǎn)角中的第2個(gè)殘基大都是脯氨酸。
超二級(jí)結(jié)構(gòu)(super-secondary structure):
也稱之基元(motif)。在蛋白質(zhì)中,特別是球蛋白中,經(jīng)??梢钥吹接扇舾上噜彽亩?jí)結(jié)構(gòu)單元組合在一起,彼此相互作用,形成的有規(guī)則、在空間上能辨認(rèn)的二級(jí)結(jié)構(gòu)組合體。
結(jié)構(gòu)域(domain):
在蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)內(nèi)的獨(dú)立折疊單元。結(jié)構(gòu)域通常都是幾個(gè)超二級(jí)結(jié)構(gòu)單元的組合。
纖維蛋白(fibrous proteins):
一類主要的不溶于水的蛋白質(zhì),通常都含有呈現(xiàn)相同二級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈。許多纖維蛋白結(jié)合緊密,并為單個(gè)細(xì)胞或整個(gè)生物體提供機(jī)械強(qiáng)度,起著保護(hù)或結(jié)構(gòu)上的作用。
球蛋白(globular proteins):
一類蛋白質(zhì),許多都溶于水,球蛋白是緊湊的、近似球形的、含有折疊緊密的多肽鏈。典型的球蛋白含有能特異識(shí)別和結(jié)合其它化合物的凹陷或裂隙部位。
角蛋白(keratins):
由處于α-螺旋或β-折疊構(gòu)象的平行的多肽鏈組成的不溶于水的起著保護(hù)或結(jié)構(gòu)作用的蛋白質(zhì)。
膠原(蛋白)(collagen):
是動(dòng)物結(jié)締組織中最豐富的一種結(jié)構(gòu)蛋白,它是由原膠原蛋白分子組成,原膠原蛋白是一種具有右手超螺旋結(jié)構(gòu)的蛋白。每個(gè)原膠原分子都是由3條特殊的左手螺旋(螺距0.95nm,每一圈含有3.3個(gè)殘基)的多肽鏈右手旋轉(zhuǎn)形成的。
疏水相互作用(hydrophobic interaction):
非極性分子之間的一種弱的、非共價(jià)的相互作用。這些非極性分子(如一些中性氨基酸殘基,也稱之疏水殘基)在水相環(huán)境中具有避開水而相互聚集的傾向。
伴娘蛋白(chaperone):
與一種新合成的多肽鏈形成復(fù)合物并協(xié)助它正確折疊成具有生物功能構(gòu)象的蛋白質(zhì)。伴娘蛋白可以防止不正確折疊中間體的形成和沒有組裝的蛋白亞基的不正確的聚集,協(xié)助多肽鏈跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)以及大的多亞基蛋白質(zhì)的組裝和解體。
二硫鍵(disulfide bond):
通過(guò)兩個(gè)(半胱氨酸)巰基的氧化形成的共價(jià)鍵。二硫鍵在穩(wěn)定某些蛋白的三維結(jié)構(gòu)上起著重要的作用。
范德華力(van der Waals force):
中性原子之間通過(guò)瞬間靜電相互作用產(chǎn)生的一種弱的分子之間的力。當(dāng)兩個(gè)原子之間的距離為它們的范德華半徑之和時(shí),范德華引力最強(qiáng)。強(qiáng)的范德華排斥作用可以防止原子相互靠近。
蛋白質(zhì)變性(denaturation):
生物大分子的天然構(gòu)象遭到破壞導(dǎo)致其生物活性喪失的現(xiàn)象。蛋白質(zhì)在受到光照、熱、有機(jī)溶劑以及一些變性劑的作用時(shí),次級(jí)鍵受到破壞,導(dǎo)致天然構(gòu)象的破壞,使蛋白質(zhì)的生物活性喪失。
復(fù)性(renaturation):
在一定的條件下,變性的生物大分子恢復(fù)成具有生物活性的天然構(gòu)象的現(xiàn)象。
肌紅蛋白(myoglobin):
是由一條肽鏈和一個(gè)血紅素輔基組成的結(jié)合蛋白,是肌肉內(nèi)儲(chǔ)存氧的蛋白質(zhì),它的氧飽和曲線為雙曲線型。
血紅蛋白(hemoglobin):
是由含有血紅素輔基的4個(gè)亞基組成的寡聚蛋白。血紅蛋白負(fù)責(zé)將氧由肺運(yùn)輸?shù)酵庵芙M織,它的氧飽和曲線為S型。
波爾效應(yīng)(Bohr effect):
CO2濃度的增加降低細(xì)胞內(nèi)的pH,引起紅細(xì)胞內(nèi)血紅蛋白的氧親和力下降的現(xiàn)象。
別構(gòu)效應(yīng)(allosteric effect):
又稱之變構(gòu)效應(yīng)。是寡聚蛋白與配基結(jié)合改變蛋白質(zhì)的構(gòu)象,導(dǎo)致蛋白質(zhì)生物活性改變的現(xiàn)象。
鐮刀型細(xì)胞貧血?。╯ickle-cell anemia):血紅蛋白分子遺傳缺陷造成的一種疾病,病人的大部分紅細(xì)胞呈鐮刀狀。其特點(diǎn)是病人的血紅蛋白β-亞基N端的第6個(gè)氨基酸殘基是纈氨酸,而不是正常的谷氨酸殘基。
酶(enzyme):
生物催化劑,除少數(shù)RNA外幾乎都是蛋白質(zhì)。酶不改變反應(yīng)的平衡,只是通過(guò)降低活化能加快反應(yīng)的速度。
全酶(holoenzyme):
具有催化活性的酶,包括所有的必需的亞基、輔基和其它的輔助因子。
脫輔基酶蛋白(apoenzyme):
酶中除去催化活性可能需要的有機(jī)或無(wú)機(jī)輔助因子或輔基后的蛋白質(zhì)部分。
酶活力單位(U,active unit):
酶活力的度量單位。1961年國(guó)際酶學(xué)會(huì)議規(guī)定:1個(gè)酶活力單位是指在特定條件(25℃,其它為最適條件)下,在1分鐘內(nèi)能轉(zhuǎn)化1微摩爾底物的酶量,或是轉(zhuǎn)化底物中1微摩爾的有關(guān)基團(tuán)的酶量。
比活(specific activity):
每分鐘每毫克酶蛋白在25℃下轉(zhuǎn)化的底物的微摩爾數(shù)(μm)。比活是酶純度的測(cè)量。
活化能(activation energy):
將一摩爾反應(yīng)底物中的所有分子由基態(tài)轉(zhuǎn)化為過(guò)渡態(tài)所需要的能量。
活性部位(active site):
酶中含有底物結(jié)合部位和參與催化底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的氨基酸殘基的部分?;钚圆课煌ǔ6嘉挥诘鞍踪|(zhì)的結(jié)構(gòu)域或亞基之間的裂隙或是蛋白質(zhì)表面的凹陷部位,通常都是由在三維空間上靠得很近的一些氨基酸殘基組成的。
酸-堿催化(acid-base catalysis):質(zhì)子轉(zhuǎn)移加速反應(yīng)的催化作用。
共價(jià)催化(covalent catalysis):
一個(gè)底物或底物的一部分與催化劑形成共價(jià)鍵,然后被轉(zhuǎn)移給第二個(gè)底物。許多酶催化的基團(tuán)轉(zhuǎn)移反應(yīng)都是通過(guò)共價(jià)催化方式進(jìn)行的。
靠近效應(yīng)(proximity effect):
非酶促反應(yīng)或酶促反應(yīng)速率的增加是由于活性部位處反應(yīng)劑有效濃度增大(底物靠近活性部位)的結(jié)果,這將導(dǎo)致更頻繁地形成過(guò)渡態(tài)。
初速度(initial velocity):
酶促反應(yīng)最初階段底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的速度,這一階段產(chǎn)物的濃度非常低,其逆反應(yīng)可以忽略不計(jì)。
米氏方程(Michaelis-Menten equation):
表示一個(gè)酶促反應(yīng)的起始速度(v)與底物濃度([S])關(guān)系的速度方程,v=Vmax[S]/(Km+[S])。
米氏常數(shù)(Michaelis constant,)(Km):
對(duì)于一個(gè)給定反應(yīng),導(dǎo)致酶促反應(yīng)速度的起始速度(v0)達(dá)到最大反應(yīng)速度(Vmax)一半時(shí)的底物濃度。
催化常數(shù)(catalytic number)(Kcat):
也稱之轉(zhuǎn)換數(shù)(turnover number)。一個(gè)動(dòng)力學(xué)常數(shù),是在底物濃度處于飽和狀態(tài)下,一個(gè)酶(或一個(gè)酶活性部位)催化一個(gè)反應(yīng)有多快的測(cè)量。催化常數(shù)等于最大反應(yīng)速度除以總的酶濃度(Vmax/[E]total),或者是每摩爾酶活性部位每秒鐘轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的底物的摩爾數(shù)。
雙倒數(shù)作圖(double-reciprocal plot):
也稱之Lineweaver-Burk作圖。一個(gè)酶促反應(yīng)速度的倒數(shù)(1/v)對(duì)底物濃度的倒數(shù)(1/[s])的作圖。X和y軸上的截距分別代表米氏常數(shù)(Km)和最大反應(yīng)速度(Vmax)的倒數(shù)。
競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用(competitive inhibition):
通過(guò)增加底物濃度可以逆轉(zhuǎn)的一種酶抑制類型。一個(gè)競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑通常與正常的底物或配體競(jìng)爭(zhēng)同一個(gè)蛋白質(zhì)的結(jié)合部位。這種抑制使得Km增大,而Vmax不變。
非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用(noncompetitive inhibition):
抑制劑不僅與游離酶結(jié)合,也可以與酶-底物復(fù)合物結(jié)合的一種酶促反應(yīng)抑制作用。這種抑制使得Vmax變小,但Km不變。
反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用(uncompetitive inhibition):
抑制劑只與酶-底物復(fù)合物結(jié)合,而不與游離酶結(jié)合的一種酶促反應(yīng)抑制作用。這種抑制作用使得Vmax,Km都變小,但Vmax/Km比值不變。
絲氨酸蛋白酶(serine protease):
活性部位含有在催化期間起著親核體作用的絲氨酸殘基的蛋白酶。
酶原(zymogen):
通過(guò)有限蛋白水解能夠由無(wú)活性變成具有催化活性的酶前體。
調(diào)節(jié)酶(regulatory enzyme):
位于一個(gè)或多個(gè)代謝途徑內(nèi)的一個(gè)關(guān)鍵部位的酶,它的活性根據(jù)代謝的需要被增加或降低。
別構(gòu)酶(allosteric enzyme):
一種其活性受到結(jié)合在活性部位以外部位的其它分子調(diào)節(jié)的酶。
別構(gòu)調(diào)節(jié)劑(allosteric modulator):
結(jié)合在別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)部位調(diào)節(jié)該酶催化活性的生物分子,別構(gòu)調(diào)節(jié)劑可以是激活劑,也可以是抑制劑。
齊變模式(concerted model):
相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的一種模式。按照最簡(jiǎn)單齊變模式,由于一個(gè)底物或別構(gòu)調(diào)節(jié)劑的結(jié)合,蛋白質(zhì)的構(gòu)象在T(對(duì)底物親和性低的構(gòu)象)和R(對(duì)底物親和性高的構(gòu)象)之間變換。這一模式提出所有蛋白質(zhì)的亞基都具有同樣的構(gòu)象,或是T,或是R構(gòu)象。
序變模式(sequential model):
相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的另外一種模式。按照最簡(jiǎn)單的序變模式,一個(gè)配體的結(jié)合會(huì)誘導(dǎo)它結(jié)合的亞基的三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化,以及使相鄰亞基的構(gòu)象發(fā)生很大的變化。按照序變模式,只有一個(gè)亞基對(duì)配體具有高的親和性。
同功酶(isoenzyme或isozyme):
催化同一化學(xué)反應(yīng)而化學(xué)組成不同的一組酶。它們彼此在氨基酸序列、底物的親和性等方面都存在著差異。
別構(gòu)調(diào)節(jié)物(allosteric modulator):
也稱之別構(gòu)效應(yīng)物(allosteric effector)。結(jié)合在別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)部位,調(diào)節(jié)酶催化活性的生物分子。別構(gòu)調(diào)節(jié)物可以是激活劑或抑制劑維生素(vitamin):
是一類動(dòng)物本身不能但對(duì)動(dòng)物生長(zhǎng)和健康又是必需的有機(jī)化合物,所以必須從飲食中獲得。許多輔酶都是由維生素衍生的。
水溶性維生素(water-soluble vitamins):
一類能溶于水的有機(jī)營(yíng)養(yǎng)分子。其中包括在酶的催化中起著重要作用的B族維生素以及抗壞血酸(維生素C)等。
脂溶性維生素(lipid vitamins):
由長(zhǎng)的碳?xì)滏溁虺憝h(huán)組成的聚戊二烯化合物。脂溶性維生素包括維生素A、D、E和K,這類維生素能被動(dòng)物貯存。
輔酶(coenzyme):
某些酶在發(fā)揮催化作用時(shí)所需要的一類輔助因子,其成分中往往含有維生素。
輔基(prosthetic group):
是與酶蛋白共價(jià)結(jié)合的金屬離子或一類有機(jī)化合物,用透析法不能除去。輔基在整個(gè)酶促反應(yīng)過(guò)程中始終與酶的特定部位結(jié)合。
尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸和尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP+,nicotinamide adenine dinucleotide phosphate):
含有尼克酰胺的輔酶,在某些氧化還原反應(yīng)中起著氫原子和電子載體的作用,常常作為脫氫酶的輔酶。
黃素單核苷酸(FMN, flavin mononucleotide):
核黃素磷酸,是某些氧化還原酶的輔酶。
黃素腺嘌呤二核苷酸(FAD, flavin adenine dinucleotide):
是某些氧化還原酶的輔酶,含有核黃素。
硫胺素焦磷酸(thiamine pyrophosphate):是維生素B1的輔酶形式,參與轉(zhuǎn)醛基反應(yīng)。
磷酸吡哆醛(pyidoxal phosphate):
是維生素B6(吡哆醇)的衍生物,是轉(zhuǎn)氨酶、脫羧酶和消旋酶的輔酶。
生物素(biotin):參與脫羧反應(yīng)的一種酶的輔助因子。
輔酶A(coenzyme A):一種含有泛酸的輔酶,在某些酶促反應(yīng)中作為?;妮d體。
類胡蘿卜素(carotenoids):由異戊二烯組成的脂溶性光合色素。
轉(zhuǎn)氨酶(transaminases):
也稱之氨基轉(zhuǎn)移酶(aminotransferases),在該酶的催化下一個(gè)α-氨基酸的氨基轉(zhuǎn)可移給另一個(gè)α-酮酸。
醛糖(aldoses):一類單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的碳原子(指定為C-1)是個(gè)醛基。
酮糖(ketoses):一類單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的碳原子(指定為C-2)是個(gè)酮基。
異頭物(anomers):
僅在氧化數(shù)最高的碳原子(異頭碳)具有不同構(gòu)型的糖分子的兩種異構(gòu)體。
異頭碳(anomeric carbon):
一個(gè)環(huán)化單糖的氧化數(shù)最高的碳原子。異頭碳具有一個(gè)羰基的化學(xué)反應(yīng)性。
變旋(mutarotation):
一個(gè)吡喃糖、呋喃糖或糖苷伴隨著它們的α-和β-異構(gòu)形式的平衡而發(fā)生的比旋度變化。
單糖(monosaccharide):由三個(gè)或更多碳原子組成的具有經(jīng)驗(yàn)公式(CH2O)n的簡(jiǎn)單糖。
糖苷(glycosides):
單糖半縮醛羥基與另一個(gè)分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羥基、胺基或巰基縮合形成的含糖衍生物。
糖苷鍵(glycosidic bond):
一個(gè)糖半縮醛羥基與另一個(gè)分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羥基、胺基或巰基之間縮合形成的縮醛或縮酮鍵,常見的糖苷鍵有O-糖苷鍵和N-糖苷鍵。
寡糖(oligoccharide):由2個(gè)~20個(gè)單糖殘基通過(guò)糖苷鍵連接形成的聚合物。
多糖(polysaccharide):
20個(gè)以上的單糖通過(guò)糖苷鍵連接形成的聚合物。多糖鏈可以是線性的或帶有分支的。
還原糖(reducing sugar):
羰基碳(異頭碳)沒有參與形成糖苷鍵,因此可被氧化充當(dāng)還原劑的糖。
淀粉(starch):
一類可作為植物中貯存多糖的葡萄糖殘基的同聚物。由兩種形式的淀粉:一種是直鏈淀粉,是沒有分支的只是通過(guò)α-(1→4)糖苷鍵連接的葡萄糖殘基聚合物。另一種是支鏈淀粉,是含有分支的α-(1→4)糖苷鍵連接的葡萄糖殘基聚合物,支鏈在分支點(diǎn)處通過(guò)α-(1→6)糖苷鍵與主鏈相連。
糖原(glycogen):
是含有分支的α-(1→4)糖苷鍵連接在一起的葡萄糖的同聚物,支鏈在分支點(diǎn)處通過(guò)α-(1→6)糖苷鍵與主鏈相連。
極限糊精(limit dexitrin):
是指支鏈淀粉中帶有支鏈的核心部分,該部分在支鏈淀粉經(jīng)淀粉酶水解作用、糖原磷酸化酶或淀粉磷酸化酶作用后仍然存在。糊精的進(jìn)一步降解需要α(1→6)糖苷鍵的水解。
肽聚糖(peptidoglycan):
N-乙酰葡萄糖胺和N-乙酰唾液酸交替連接的雜多糖與不同組成的肽交叉連接形成的大分子。肽聚糖是許多細(xì)菌細(xì)胞壁的主要成分。
糖蛋白(glycoprotein):含有共價(jià)連接的葡萄糖殘基的蛋白質(zhì)。
蛋白聚糖(proteoglycans):
由雜多糖與一個(gè)多肽鏈組成的雜化的大分子,多糖是分子的主要成分。
脂肪酸(fatty acid):
是指一端含有一個(gè)羧基的長(zhǎng)的脂肪族碳?xì)滏?。脂肪酸是最?jiǎn)單的一種脂,它是許多更復(fù)雜的脂(例如三脂酰甘油、甘油磷脂、鞘磷脂和蠟)的成分。
飽和脂肪酸(saturated fatty acid):不含有-C=C-雙鍵的脂肪酸。
不飽和脂肪酸(unsaturated fatty acid):至少含有一個(gè)-C=C-雙鍵的脂肪酸。
必需脂肪酸(ossential fatty acids):
維持哺乳動(dòng)物正常生長(zhǎng)所需的,而動(dòng)物又不能合成的脂肪酸,例如亞油酸和亞麻酸。
三脂酰甘油(triacylglycerol):
也稱之甘油三酯(triglyceride)。一種含有與甘油酯化的3個(gè)脂酰基的脂。脂肪和油是三脂酰甘油的混合物。
磷脂(phospholipid):含有磷酸成分的脂。例如卵磷脂、腦磷脂等。
鞘脂(sphingolipids):
一類含有鞘氨醇骨架的兩性脂,一端連接著一個(gè)長(zhǎng)鏈的脂肪酸,了一端為一個(gè)極性的醇。鞘脂包括鞘磷脂、腦磷脂以及神經(jīng)節(jié)苷脂,一般存在于植物和動(dòng)物膜內(nèi),尤其是在中樞神經(jīng)系統(tǒng)的組織內(nèi)含量豐富。
鞘磷脂(sphingomyelin):
一種由神經(jīng)酰胺的C-1羥基上連接了磷酸膽堿(或磷酸乙醇胺)構(gòu)成的鞘脂。鞘磷脂存在于大多數(shù)哺乳動(dòng)物細(xì)胞的質(zhì)膜內(nèi),是髓鞘的主要成分。
卵磷脂(lecithin):
就是磷脂酰膽堿(PC,phosphatidyl choline),是磷脂酸與膽堿形成的酯。
腦磷脂(cephalin):
就是磷脂酰乙醇胺(PE,phosphatidyl ethanolamine),是磷脂酸與乙醇胺形成的酯。
脂質(zhì)體(liposome):是由包圍水相空間的磷脂雙層形成的囊泡(小泡)。
生物膜(bioligical membrane):
鑲嵌有蛋白質(zhì)的脂雙層,起著劃分和分隔細(xì)胞和細(xì)胞器的作用。生物膜也是許多與能量轉(zhuǎn)化和細(xì)胞內(nèi)通訊有關(guān)的重要部位。
內(nèi)在膜蛋白(integral membrane proteins):
插入脂雙層的疏水核和完全跨越脂雙層的膜蛋白。
外周膜蛋白(peripheral membrane proteins):
通過(guò)與膜脂的極性頭部或內(nèi)在膜蛋白的離子相互作用和形成氫鍵與膜的內(nèi)、外表面弱結(jié)合的膜蛋白。膜蛋白一旦從膜上釋放出來(lái),通常都是水溶性的。
流體鑲嵌模型(fluid mosaic model):
針對(duì)生物膜的結(jié)構(gòu)提出的一種模型。在這個(gè)模型中,生物膜被描述成鑲嵌有蛋白質(zhì)的流體脂雙層,脂雙層在結(jié)構(gòu)和功能上都表現(xiàn)出不對(duì)稱性。有的蛋白質(zhì)“鑲”在脂雙層表面,有的則部分或全部嵌入其內(nèi)部,有的則橫跨整個(gè)膜。另外脂和膜蛋白都可以進(jìn)行橫向擴(kuò)散。
通透系數(shù)(permeability coefficient):
是離子或小分子擴(kuò)散過(guò)脂雙層膜能力的一種量度。
通道蛋白(channel proteins):
是一種帶有中央水相通道的內(nèi)在膜蛋白,它可以使大小合適的離子和分子從膜的任一方向穿過(guò)膜。
(膜)孔蛋白(pore proteins):其含義與通道蛋白類似,只是該術(shù)語(yǔ)常用于細(xì)菌。
被動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)(passive transport):
也稱之易化擴(kuò)散(facilitated diffusion)。是一種轉(zhuǎn)運(yùn)方式,通過(guò)該方式溶質(zhì)特異結(jié)合于一個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,然后被轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)膜,但轉(zhuǎn)運(yùn)是沿著濃度梯度下降方向進(jìn)行,所以被動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)不需要能量支持。
主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)(active transport):
一種轉(zhuǎn)運(yùn)方式,通過(guò)該方式溶質(zhì)特異結(jié)合于一個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,然后被轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)膜,但與被動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)方式相反轉(zhuǎn)運(yùn)是逆著濃度梯度方向進(jìn)行的,所以主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)需要能量來(lái)驅(qū)動(dòng)。在原發(fā)主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程中,能源可以是光、ATP或電子傳遞。而第二級(jí)主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)是在離子濃度梯度驅(qū)動(dòng)下進(jìn)行的。
協(xié)同運(yùn)送(cotransport):
兩種不同溶質(zhì)跨膜的耦聯(lián)轉(zhuǎn)運(yùn)??梢酝ㄟ^(guò)一個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白進(jìn)行同一方向(同向轉(zhuǎn)運(yùn))或反方向(反向轉(zhuǎn)運(yùn))轉(zhuǎn)運(yùn)。
胞吞(作用)(endocytosis):
物質(zhì)被質(zhì)膜吞入并以膜衍生出的脂囊泡形式(物質(zhì)在囊泡內(nèi))并被帶入到細(xì)胞內(nèi)的過(guò)程。
胞吐(作用)(exocytosis):
確定要分泌的物質(zhì)被包裹在脂囊泡內(nèi),該囊泡與質(zhì)膜融合,然后將物質(zhì)釋放到細(xì)胞外空間的過(guò)程。
核苷(nucleoside):
是由嘌呤或嘧啶堿基通過(guò)共價(jià)鍵與戊糖連接組成的化合物。核糖與堿基一般都是由糖的異頭碳與嘧啶的N-1或嘌呤的N-9之間形成的β-N-糖苷鍵連接的。
核苷酸(nucleotide):核苷的戊糖成分中的羥基磷酸化形成的化合物。
cAMP(cyclic AMP):
3ˊ,5ˊ-環(huán)腺苷酸,細(xì)胞內(nèi)的第二信使,由于某些激素或其它分子信號(hào)刺激激活腺苷酸環(huán)化酶催化ATP環(huán)化形成的。
磷酸二酯鍵(phosphodiester linkage):
一種化學(xué)基團(tuán),指一分子磷酸與兩個(gè)醇(羥基)酯化形成的兩個(gè)酯鍵。該酯鍵成了兩個(gè)醇之間的橋梁。例如一個(gè)核苷的3ˊ羥基與另一個(gè)核苷的5ˊ羥基與同一分子磷酸酯化,就形成了一個(gè)磷酸二酯鍵。
脫氧核糖核酸(DNA , deoxyribonucleic acid):
含有特殊脫氧核糖核苷酸序列的聚脫氧核苷酸,脫氧核苷酸之間是通過(guò)3ˊ,5ˊ-磷酸二酯鍵連接的。DNA是遺傳信息的載體。
核糖核酸(RNA , ribonucleic acid):
通過(guò)3ˊ,5ˊ-磷酸二酯鍵連接形成的特殊核糖核苷酸序列的聚核糖核苷酸。
核糖體核糖核酸(rRNA, ribosomal robonucleic acid):
作為核糖體組成成分的一類RNA,rRNA是細(xì)胞內(nèi)最豐富的RNA.信使核糖核酸(mRNA, messenger ribonucleic acid):一類用作蛋白質(zhì)合成模板的RNA.轉(zhuǎn)移核糖核酸(tRNA, transfer ribonucleic acid):
一類攜帶激活氨基酸,將它帶到蛋白質(zhì)合成部位并將氨基酸整合到生長(zhǎng)著的肽鏈上的RNA.tRNA含有能識(shí)別模板mRNA上互補(bǔ)密碼的反密碼。
轉(zhuǎn)化(作用)(transformation):
一個(gè)外源DNA通過(guò)某種途徑導(dǎo)入一個(gè)宿主菌,引起該細(xì)菌的遺傳特性改變的作用。
轉(zhuǎn)導(dǎo)(作用)(transduction):
借助于病毒載體,遺傳信息從一個(gè)細(xì)胞轉(zhuǎn)移到另一個(gè)細(xì)胞。
堿基對(duì)(base pair):
通過(guò)堿基之間氫鍵配對(duì)的核酸鏈中的兩個(gè)核苷酸,例如A與T或U,以及G與C配對(duì)。
查格夫法則(Chargaff‘s rules):
所有DNA中腺嘌呤與胸腺嘧啶的摩爾含量相等,(A=T),鳥嘌呤和胞嘧啶的摩爾含量相等(G=C),即嘌呤的總含量與嘧啶的總含量相等(A+G=T+C)。DNA的堿基組成具有種的特異性,但沒有組織和器官的特異性。另外生長(zhǎng)發(fā)育階段、營(yíng)養(yǎng)狀態(tài)和環(huán)境的改變都不影響DNA的堿基組成。
DNA雙螺旋(DNA double helix):
一種核酸的構(gòu)象,在該構(gòu)象中,兩條反向平行的多核苷酸鏈圍繞彼此纏繞形成一個(gè)右手的雙螺旋結(jié)構(gòu)。堿基位于雙螺旋內(nèi)側(cè),磷酸與糖基在外側(cè),通過(guò)磷酸二酯鍵相連,形成核酸的骨架。堿基平面與假想的中心軸垂直,糖環(huán)平面則與軸平行。兩條鏈皆為右手螺旋。雙螺旋的直徑為2nm,堿基堆積距離為0.34nm,兩核苷酸之間的夾角是36°,每對(duì)螺旋由10對(duì)堿基組成,堿基按A-T, G-C配對(duì)互補(bǔ),彼此以氫鍵相連系。維持DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的力主要是堿基堆積力。雙螺旋表面有兩條寬窄、深淺不一的一個(gè)大溝和一個(gè)小溝。
大溝(major groove)和小溝(minor groove):
繞B-DNA雙螺旋表面上出現(xiàn)的螺旋槽(溝),寬的溝稱之大溝,窄溝稱之小溝。大溝、小溝都是由于堿基對(duì)堆積和糖-磷酸骨架扭轉(zhuǎn)造成的。
DNA超螺旋(DNA supercoiling):
DNA本身的卷曲,一般是DNA雙螺旋的彎曲、欠旋(負(fù)超螺旋)或過(guò)旋(正超螺旋)的結(jié)果。
拓?fù)洚悩?gòu)酶(topoisomerase):
通過(guò)切斷DNA的一條或兩條鏈中的磷酸二酯鍵,然后重新纏繞和封口來(lái)改變DNA連環(huán)數(shù)的酶。拓?fù)洚悩?gòu)酶I通過(guò)切斷DNA中的一條鏈減少負(fù)超螺旋,增加一個(gè)連環(huán)數(shù);而拓?fù)洚悩?gòu)酶II切斷DNA的兩條鏈增加負(fù)超螺旋,減少2 個(gè)連環(huán)數(shù)。某些拓?fù)洚悩?gòu)酶II也稱之DNA促旋酶。
核小體(nucleosome):用于包裝染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)單位,是由DNA鏈繞一個(gè)組蛋白核纏繞構(gòu)成的。
染色質(zhì)(chromatin):
是存在于真核生物間期細(xì)胞核內(nèi),易被堿性染料著色的一種無(wú)定形物質(zhì)。染色質(zhì)中含有作為骨架的完整的雙鏈DNA,以及組蛋白、非組蛋白和少量的RNA.染色體(chromosome):
是染色質(zhì)在細(xì)胞分裂過(guò)程中經(jīng)過(guò)緊密纏繞、折疊、凝縮和精細(xì)包裝形成的具有固定形態(tài)的遺傳物質(zhì)存在形式。簡(jiǎn)言之,染色體是一個(gè)大的單一的雙鏈DNA分子與相關(guān)蛋白質(zhì)組成的復(fù)合物,DNA中含有許多基因,貯存和傳遞遺傳信息。
DNA變性(DNA denaturation):DNA雙鏈解鏈分離成兩條單鏈的現(xiàn)象。
退火(annealing):
即DNA由單鏈復(fù)性變成雙鏈結(jié)構(gòu)的過(guò)程。來(lái)源相同的DNA單鏈經(jīng)退火后完全恢復(fù)雙鏈結(jié)構(gòu),同源DNA之間、DNA和RNA之間退火后形成雜交分子。
融解溫度(melting temperature, Tm):
雙鏈DNA融解徹底變成單鏈DNA的溫度范圍的中點(diǎn)溫度。
增色效應(yīng)(hyperchromic effect):
當(dāng)雙螺旋DNA融解(解鏈)時(shí),260nm處紫外吸收增加的現(xiàn)象。
減色效應(yīng)(hypochromic effect):隨著核酸復(fù)性,紫外吸收降低的現(xiàn)象。
核酸內(nèi)切酶(endonuclease):
核糖核酸酶和脫氧核糖核酸酶中能夠水解核酸分子內(nèi)磷酸二酯鍵的酶。
核酸外切酶(exonuclease):從核酸鏈的一端逐個(gè)水解下核苷酸的酶。
限制性內(nèi)切酶(restriction endonucleases):
一種在特殊核苷酸序列處水解雙鏈DNA的內(nèi)切酶。I型限制性內(nèi)切酶既催化宿主DNA的甲基化,又催化非甲基化的DNA的水解;而II型限制性內(nèi)切酶只催化非甲基化的DNA的水解。
限制酶圖譜(restriction map):
同一DNA用不同的限制酶進(jìn)行切割從而獲得各種限制酶的切割位點(diǎn),由此建立的位點(diǎn)圖譜有助于對(duì)DNA的結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。
反向重復(fù)序列 (inverted repeat sequence):
在同一多核苷酸鏈內(nèi)的相反方向上存在的重復(fù)的核苷酸序列。在雙鏈DNA中反向重復(fù)可能引起十字形結(jié)構(gòu)的形成。
重組DNA技術(shù)(recombination DNA technology):
也稱之基因工程(genomic engineering)。利用限制性內(nèi)切酶和載體,按照預(yù)先設(shè)計(jì)的要求,將一種生物的某種目的基因和載體DNA重組后轉(zhuǎn)人另一生物細(xì)胞中進(jìn)行復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和表達(dá)的技術(shù)。
基因(gene):
也稱之順反子(cistron)。泛指被轉(zhuǎn)錄的一個(gè)DNA片段。在某些情況下,基因常用來(lái)指編碼一個(gè)功能蛋白或RNA分子的DNA片段。
分解代謝反應(yīng)(catabolic reaction):
降解復(fù)雜分子為生物體提供小的構(gòu)件分子和能量的代謝反應(yīng)。
合成代謝反應(yīng)(anabolic reaction):
合成用于細(xì)胞維持和生長(zhǎng)所需要的分子的代謝反應(yīng)。
反饋抑制(feedback inhibition):
催化一個(gè)代謝途徑中前面反應(yīng)的酶受到同一途徑的終產(chǎn)物抑制的現(xiàn)象。
前饋激活(feed-forward activation):
代謝途徑中一個(gè)酶被該途徑中前面產(chǎn)生的代謝物激活的現(xiàn)象。
標(biāo)準(zhǔn)自由能變化(ΔG°)(standard free-energy change):
在一系列標(biāo)準(zhǔn)條件(溫度:298K;壓力:1個(gè)大氣壓;所有溶質(zhì)的濃度都是1M)下發(fā)生的反應(yīng)的自由能變化。ΔG°ˊ表示pH7.0條件下的標(biāo)準(zhǔn)自由能變化。
標(biāo)準(zhǔn)還原電位(E°ˊ)
?。╯tandard reduction potential):
25℃和pH7.0條件下一個(gè)還原劑和它的氧化形式在1M濃度下表現(xiàn)出的電動(dòng)勢(shì)。
酵解(glycolysis):
一個(gè)由10步酶促反應(yīng)組成的糖分解代謝途徑,通過(guò)該途徑,一分子葡萄糖轉(zhuǎn)換為兩分子丙酮酸,同時(shí)凈生成兩分子ATP和兩分子NADH.發(fā)酵(fermentation):
營(yíng)養(yǎng)分子(例如葡萄糖)產(chǎn)能的厭氧降解,在乙醇發(fā)酵中,丙酮酸轉(zhuǎn)化為乙醇和CO2.巴斯德效應(yīng)(Pasteur effect):氧存在下,酵解速度放慢的現(xiàn)象。
底物水平磷酸化(substrate phosphorylation):
ADP或某些其它的核苷-5ˊ-二磷酸的磷酸化是通過(guò)來(lái)自一個(gè)非核苷酸底物的磷?;霓D(zhuǎn)移實(shí)現(xiàn)的。這種磷酸化與電子傳遞鏈無(wú)關(guān)。
檸檬酸循環(huán)(citric acid cycle):
也稱之三羧酸循環(huán)(tricarboxylic acid cycle),Krebs 循環(huán)(Krebs cycle)。是用于乙酰CoA中的乙?;趸蒀O2的酶促反應(yīng)的循環(huán)系統(tǒng),該循環(huán)的第一步反應(yīng)是由乙酰CoA和草酰乙酸縮合形成檸檬酸。
回補(bǔ)反應(yīng)(anaplerotic reaction):
酶催化的補(bǔ)充檸檬酸循環(huán)中間代謝物的供給的反應(yīng),例如由丙酮酸羧化生成草酰乙酸的反應(yīng)。
乙醛酸循環(huán)(glyoxylate cycle):
是某些植物、細(xì)菌和酵母中檸檬酸循環(huán)的修改形式,通過(guò)該循環(huán)可以由乙酰CoA經(jīng)草酰乙酸凈生成葡萄糖。乙醛酸循環(huán)繞過(guò)了檸檬酸循環(huán)中生成兩個(gè)CO2的步驟。
戊糖磷酸途徑(pentose phosphate pathway):
也稱之磷酸己糖支路(hexose monophosphate shunt)。是一個(gè)葡萄糖-6-磷酸經(jīng)代謝產(chǎn)生NADPH和核糖-5-磷酸的途徑。該途徑包括氧化和非氧化兩個(gè)階段,在氧化階段,葡萄糖-6-磷酸轉(zhuǎn)化為核酮糖-5-磷酸和CO2,并生成兩分子的NADPH;在非氧化階段,核酮糖-5-磷酸異構(gòu)化生成核糖-5-磷酸或轉(zhuǎn)化為酵解中的兩個(gè)中間代謝物果糖-6-磷酸和甘油醛-3-磷酸。
糖醛酸途徑(glucuronate pathway):
從葡萄糖-6-磷酸或葡萄糖-1-磷酸開始,經(jīng)UDP-葡萄糖醛酸生成葡萄糖醛酸和抗壞血酸的途徑。但只有在植物和那些可以合成抗壞血酸(維生素C)動(dòng)物體內(nèi),通過(guò)該途徑可以合成維生素C.無(wú)效循環(huán)(futile cycle):
也稱之底物循環(huán)(substrate cycle)。一對(duì)催化兩個(gè)途徑的中間代謝物之間循環(huán)的方向相反、代謝上不可逆的反應(yīng)。有時(shí)該循環(huán)通過(guò)ATP的水解導(dǎo)致熱能的釋放。例如,葡萄糖+ATP=葡萄糖-6-磷酸+ADP與葡萄糖-6-磷酸+H2O=葡萄糖+Pi反應(yīng)組成的循環(huán)反應(yīng),其凈反應(yīng)實(shí)際上是ATP+H2O=ADP+Pi.磷酸解(作用)(phosphorolysis):
在分子內(nèi)通過(guò)引入一個(gè)無(wú)機(jī)磷酸形成磷酸酯鍵而使原來(lái)鍵斷裂的方式。實(shí)際上引入了一個(gè)磷?;?。
半乳糖血癥(galactosemia):
人類的一種基因型遺傳代謝缺陷,特點(diǎn)是由于缺乏1-磷酸半乳糖尿苷酰轉(zhuǎn)移酶導(dǎo)致嬰兒不能代謝奶汁中乳糖分解生成的半乳糖。
尾部生長(zhǎng)(tailward growth):
一種聚合反應(yīng)機(jī)理,經(jīng)過(guò)活化的單體的頭部結(jié)到聚合物的尾部,連接到聚合物尾部的單體的尾部又成了接收下一個(gè)單體的受體。
糖異生作用(gluconeogenesis):
由簡(jiǎn)單的非糖前體轉(zhuǎn)變?yōu)樘堑倪^(guò)程。糖異生不是糖酵解的簡(jiǎn)單逆轉(zhuǎn)。雖然由丙酮酸開始的糖異生利用了糖酵解中的7步近似平衡反應(yīng)的逆反應(yīng),但還必須利用另外4步酵解中不曾出現(xiàn)的酶促反應(yīng)繞過(guò)酵解中的三個(gè)不可逆反應(yīng)。
呼吸電子傳遞鏈(respiratory electron-transport chain):
由一系列可作為電子載體的酶復(fù)合體和輔助因子構(gòu)成,可將來(lái)自還原型輔酶或底物的電子傳遞給有氧代謝的最終電子受體分子氧(O2)。
氧化磷酸化(oxidative phosphorylation):
電子從一個(gè)底物傳遞給分子氧的氧化與酶催化的由ADP和Pi生成ATP的磷酸化相偶聯(lián)的過(guò)程。
化學(xué)滲透理論(chemiosmotic theory):
一種學(xué)說(shuō),主要論點(diǎn)是底物氧化期間建立的質(zhì)子濃度梯度提供了驅(qū)動(dòng)由ADP和Pi形成ATP的能量。
解偶聯(lián)劑(uncoupling agent):
一種使電子傳遞與ADP磷酸化之間的緊密偶聯(lián)關(guān)系解除的化合物,例如2,4-二硝基苯酚。
P/O比(P/O ratio):
在氧化磷酸化中,每1/2O2被還原時(shí)形成的ATP的摩爾數(shù)。電子從NADH傳遞給O2時(shí),P/O比為3,而電子從FADH2傳遞給O2時(shí),P/O比為2.
高能化合物(high energy compound):
在標(biāo)準(zhǔn)條件下水解時(shí)自由能大幅度減少的化合物。一般是指水解釋放的能量能驅(qū)動(dòng)ADP磷酸化合成ATP的化合物。
葉綠體(chloroplast):藻類和植物中含有葉綠素進(jìn)行光合作用的器官。
葉綠素(chlorophyll):
光合作用膜中的綠色色素,它是光合生物中主要的捕獲光的成分。
輔助色素(accessory pigments):
在植物和光合細(xì)菌中象類胡蘿卜素、葉黃素和藻膽(色)素那樣吸收可見光的色素,這類色素是對(duì)葉綠素捕獲光能的補(bǔ)充。
光合作用(photosynthesis):綠色植物或光合細(xì)菌利用光能將CO2轉(zhuǎn)化成有機(jī)化合物的過(guò)程。
光合磷酸化(photophosphorylation):
在葉綠體ATP合成酶催化下依賴于光的由ADP和Pi合成ATP的過(guò)程。
光反應(yīng)(light reactions):光合色素將光能轉(zhuǎn)變成化學(xué)能并形成ATP和NADPH的過(guò)程。
暗反應(yīng)(dark reactions):
利用光反應(yīng)生成的ATP和NADPH的化學(xué)能使CO2還原成糖或其它有機(jī)物的一系列酶促過(guò)程。
Calvin 循環(huán)(Cavin cycle):
也稱之還原戊糖磷酸循環(huán)(RPP cycle: reductive pentose phosphate cycle),C3途徑(C3 pathway)。在光合作用期間,將CO2還原轉(zhuǎn)化為糖的反應(yīng)循環(huán)。是植物用于固定二氧化碳生成磷酸丙糖的循環(huán)途徑。
C4途徑(C4 pathway):
一些植物中固定碳的途徑,其特點(diǎn)是通過(guò)使CO2濃縮減少光呼吸。在該途徑中,在葉肉細(xì)胞CO2被整合到C4酸中,然后C4酸在維管束鞘細(xì)胞被脫羧,釋放出的CO2被Calvin 循環(huán)利用。
光呼吸(photorespiration):
植物依賴光攝取氧進(jìn)行磷酸乙醇酸代謝的過(guò)程。光呼吸之所以發(fā)生是由于O2可以與CO2競(jìng)爭(zhēng)核酮糖-1,5-二磷酸羧化氧化酶的活性部位。
β氧化途徑(βoxidation pathway):
是脂肪酸氧化分解的主要途徑,脂肪酸被連續(xù)地在β碳氧化降解生成乙酰CoA,同時(shí)生成NADH和FADH2,因此可產(chǎn)生大量的ATP.該途徑因脫氫和裂解均發(fā)生在β位碳原子而得名。每一輪脂肪酸β氧化都是由4步反應(yīng)組成:氧化、水化、再氧化和硫解。
肉毒堿穿梭系統(tǒng)(carnitine shuttle system):
脂酰CoA通過(guò)形成脂酰肉毒堿從細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)到線粒體的一個(gè)穿梭循環(huán)途徑。
酮體(acetone body):
在肝臟中由乙酰CoA合成的燃料分子(β羥基丁酸、乙酰乙酸和丙酮)。在饑餓期間酮體是包括腦在內(nèi)的許多組織的燃料,酮體過(guò)多將導(dǎo)致中毒。
檸檬酸轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)(citrate transport system):
將乙酰CoA從線粒體轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞質(zhì)的穿梭循環(huán)途徑。在轉(zhuǎn)運(yùn)乙酰CoA的同時(shí),細(xì)胞質(zhì)中的NADH氧化成NAD+、NADP+還原為NADPH.每循環(huán)一次消耗2分子ATP.?;d體蛋白(ACP, acyl carrier protein):
通過(guò)硫酯鍵結(jié)合脂肪酸合成的中間代謝物的蛋白質(zhì)(原核生物)或蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域(真核生物)。
生物固氮作用(Biological nitrogen fixation):
大氣中的氮被還原為氨的過(guò)程。生物固氮只發(fā)生在少數(shù)的細(xì)菌和藻類中。
尿素循環(huán)(urea cycle):
是一個(gè)由4步酶促反應(yīng)組成的可以將來(lái)自氨和天冬氨酸的氮轉(zhuǎn)化為尿素的代謝循環(huán)。該循環(huán)是發(fā)生在脊椎動(dòng)物肝臟中的一個(gè)代謝循環(huán)。
脫氨(deamination):
在酶的催化下從生物分子(氨基酸或核苷酸分子)中除去氨基的過(guò)程。
氧化脫氨(oxidative deamination):
α-氨基酸在酶的催化下脫氨生成相應(yīng)α-酮酸的過(guò)程。氧化脫氨過(guò)程實(shí)際上包括脫氫和水解兩個(gè)步驟。
轉(zhuǎn)氨酶(transaminases):
也稱之氨基轉(zhuǎn)移酶(aminotransferases)。催化一個(gè)α-氨基酸的α-氨基向一個(gè)α-酮酸轉(zhuǎn)移的酶。
轉(zhuǎn)氨(transamination):
一個(gè)α-氨基酸的α-氨基借助轉(zhuǎn)氨酶的催化作用轉(zhuǎn)移到一個(gè)α-酮酸的過(guò)程。
乒乓反應(yīng)(ping-pong reaction):
在該反應(yīng)中,酶結(jié)合一個(gè)底物并釋放出一個(gè)產(chǎn)物,留下一個(gè)取代酶,然后該取代酶再結(jié)合第二個(gè)底物和釋放出第二個(gè)產(chǎn)物,最后酶恢復(fù)到它的起始狀態(tài)。
生糖氨基酸(glucogenic amino acids):
那些降解能生成可作為糖異生前體分子,例如丙酮酸或檸檬酸循環(huán)中間代謝物的氨基酸。
生酮氨基酸(acetonegenic amino acid):那些降解可生成乙酰CoA或酮體的氨基酸。
苯酮尿癥(phenylketonuria):
是由于苯丙氨酸羥化酶缺乏引起苯丙酮酸堆積的代謝遺傳病。缺乏苯丙氨酸羥化酶,苯丙氨酸只能靠轉(zhuǎn)氨生成苯丙酮酸,病人尿中排出大量苯丙酮酸。苯丙酮酸堆積對(duì)神經(jīng)有毒害,智力發(fā)育出現(xiàn)障礙。
尿黑酸癥(alcaptonuria):
是酪氨酸代謝中缺乏尿黑酸氧化酶引起的代謝遺傳病。這種病人尿中含有尿黑酸,在堿性條件下暴露于氧氣氧化并聚合為類似于黑色素的物質(zhì),從而使尿成黑色。
核苷磷酸化酶(nucleoside phosphorylase):
能分解核苷生成含氮堿和戊糖的磷酸酯的酶。
核苷水解酶(nucleoside hydrolase):能分解核苷生成含氮堿和戊糖的酶。
從頭合成(de novo synthesis ):
生物體內(nèi)用簡(jiǎn)單的前體物質(zhì)合成生物分子的途徑,例如核苷酸的從頭合成。
補(bǔ)救途徑(salvage pathway):
與從頭合成途徑不同,生物分子的合成,例如核苷酸可以由該類分子降解形成的中間代謝物,如堿基等來(lái)合成,該途徑是一個(gè)再循環(huán)途徑。
痛風(fēng)(gout):
是尿酸過(guò)量生產(chǎn)或尿酸排泄不充分引起的尿酸堆積造成的,尿酸結(jié)晶堆積在軟骨、軟組織、腎臟以及關(guān)節(jié)處。在關(guān)節(jié)處的沉積會(huì)造成劇烈的疼痛。
別嘌呤醇(allopurinol):
是結(jié)構(gòu)上(嘌呤環(huán)上第7位是C,第8位是N)類似于次黃嘌呤的化合物,對(duì)黃嘌呤氧化酶有很強(qiáng)抑制作用,常用來(lái)治療痛風(fēng)。
自殺抑制作用(suicide substrate):
底物類似物經(jīng)酶催化生成的產(chǎn)物變成了該酶的抑制劑。例如別嘌呤醇對(duì)黃嘌呤氧化酶的抑制就屬于這種抑制類型。
Lesch-Nyhan綜合癥(Lesch-Nyhan ):
也稱之自毀容貌癥,是由于次黃嘌呤-鳥嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶的遺傳缺陷引起的。缺乏該酶使得次黃嘌呤和鳥嘌呤不能轉(zhuǎn)換為IMP和GMP,而是降解為尿酸,過(guò)量尿酸將導(dǎo)致Lesch-Nyhan綜合癥。
激素(hormone):
一類由內(nèi)分泌組織合成的微量的化學(xué)物質(zhì),它由血液運(yùn)輸?shù)桨薪M織,起著一個(gè)信使的作用調(diào)節(jié)靶組織(器官)的功能。
激素受體(hormone receptor):
位于細(xì)胞表面或細(xì)胞內(nèi)結(jié)合特異激素并引發(fā)細(xì)胞響應(yīng)的蛋白質(zhì)。
第二信使(second messenger):
響應(yīng)外部信號(hào)(第一信使),例如激素而在細(xì)胞內(nèi)合成的效應(yīng)分子,例如cAMP、肌醇三磷酸或二?;视偷?。第二信使再去調(diào)節(jié)靶酶,引起細(xì)胞內(nèi)各種效應(yīng)。
級(jí)聯(lián)放大(cascade):
在體內(nèi)的不同部位,通過(guò)一系列的酶促反應(yīng)來(lái)傳遞一個(gè)信息,并且初始信息在傳到系列反應(yīng)的最后時(shí),信號(hào)得到放大,這樣的一個(gè)系列叫做級(jí)聯(lián)系統(tǒng)。最普通的類型是蛋白水解和蛋白質(zhì)磷酸化的級(jí)聯(lián)放大。
G蛋白(G proteins):
在細(xì)胞內(nèi)信號(hào)傳導(dǎo)途徑中起著重要作用的GTP結(jié)合蛋白質(zhì),由α、β、γ三個(gè)不同亞基組成。與激素受體結(jié)合的配體誘導(dǎo)GTP與G蛋白結(jié)合的GDP進(jìn)行交換,結(jié)果激活位于信號(hào)傳導(dǎo)途徑中下游的腺苷酸環(huán)化酶。G蛋白將胞外的第一信使腎上腺素等激素和胞內(nèi)的腺苷酸環(huán)化酶催化的腺苷酸環(huán)化生成的第二信使cAMP聯(lián)系起來(lái)。G蛋白具有內(nèi)源GTP酶活性。
激素效應(yīng)元件(hormone response elements, HRE):
是指類固醇、甲狀腺素等激素受體結(jié)合的一段短的DNA序列(12~20bp),這類受體結(jié)合DNA后可改變相鄰基因的表達(dá)。
半保留復(fù)制(semiconservative replication):
DNA復(fù)制的一種方式。每條鏈都可用作合成互補(bǔ)鏈的模板,合成出兩分子的雙鏈DNA,每個(gè)分子都是由一條親代鏈和一條新合成的鏈組成。
復(fù)制叉(replication forks):
Y字型結(jié)構(gòu),在復(fù)制叉處作為模板的雙鏈DNA解旋,同時(shí)合成新的DNA鏈。
DNA聚合酶(DNA polymerase):
以 DNA為模板催化核苷酸殘基加到已存在的聚核苷酸的3ˊ末端反應(yīng)的酶。某些DNA聚合酶具有外切核酸酶的活性,可用來(lái)校正新合成的核苷酸序列。
Klenow 片段(Klenow fragment):
E.coli DNA聚合酶I經(jīng)部分水解生成的C末端605個(gè)氨基酸殘基片段。該片段保留了DNA聚合酶I 的5ˊ-3ˊ聚合酶和3ˊ-5ˊ外切酶活性,但缺少完整酶的5ˊ-3ˊ外切酶活性。
前導(dǎo)鏈(leading strand):
與復(fù)制叉移動(dòng)的方向一致,通過(guò)連續(xù)地5ˊ→3ˊ聚合合成的新的DNA鏈。
滯后鏈(lagging strand):
與復(fù)制叉移動(dòng)的方向相反,通過(guò)不連續(xù)地5ˊ→3ˊ聚合合成的新的DNA鏈。
岡崎片段(Okazaki fragments):
相對(duì)比較短的DNA鏈(大約1000核苷酸殘基),是在DNA的滯后鏈的不連續(xù)合成期間生成的片段,這是Reiji Okazaki 在DNA合成實(shí)驗(yàn)中添加放射性的脫氧核苷酸前體觀察到的。
引發(fā)體(primosome):
一種多蛋白復(fù)合體,E.coli中的引發(fā)體包括催化滯后鏈不連續(xù)DNA合成所需要的短的RNA引物合成的引發(fā)酶、解旋酶。
復(fù)制體(replisome):
一種多蛋白復(fù)合體,包含DNA聚合酶、引發(fā)酶、解旋酶、單鏈結(jié)合蛋白和其它輔助因子。復(fù)制體位于每個(gè)復(fù)制叉處執(zhí)行著細(xì)菌染色體DNA復(fù)制的聚合反應(yīng)。
單鏈結(jié)合蛋白(SSB,single-strand binding protein):
一種與單鏈DNA結(jié)合緊密的蛋白質(zhì),它的結(jié)合可以防止復(fù)制叉處的單鏈DNA本身重新折疊回雙鏈區(qū)。
滾環(huán)復(fù)制(rolling-circle replication):
復(fù)制環(huán)狀DNA的一種模式,在該模式中,DNA聚合酶結(jié)合在一個(gè)缺口鏈的3ˊ端,繞環(huán)合成與模板鏈互補(bǔ)的DNA,每一輪都是新合成的DNA取代前一輪合成的DNA.逆轉(zhuǎn)錄酶(reverse transcriptase):
一種催化以RNA為模板合成DNA的DNA聚合酶,具有RNA指導(dǎo)的DNA合成、水解RNA和DNA指導(dǎo)的DNA合成的酶活性。
互補(bǔ)DNA (cDNA , complementary DNA):通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄酶由mRNA模板合成的雙鏈DNA.聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR, polymerase chain reaction):
擴(kuò)增樣品中的DNA量和富集眾多DNA分子中的一個(gè)特定DNA序列的一種技術(shù)。在該反應(yīng)中,使用與目的DNA序列互補(bǔ)的寡核苷酸作為引物,進(jìn)行多輪的DNA合成。其中包括DNA變性、引物退火和在Taq DNA聚合酶催化下的DNA合成。
直接修復(fù)(direct repair):
是通過(guò)一種可連續(xù)掃描DNA,識(shí)別出損傷部位的蛋白質(zhì)將損傷部位直接修復(fù)的方法。該修復(fù)方法不用切斷DNA或切除堿基。
切除修復(fù)(excision repair):
通過(guò)切除-修復(fù)內(nèi)切酶使DNA損傷消除的修復(fù)方法。一般是切去損傷區(qū),然后在DNA聚合酶的作用下以露出的單鏈為模板合成新的互補(bǔ)鏈,最后用連接酶將缺口連接起來(lái)。
錯(cuò)配修復(fù)(mismatch repair):
在含有錯(cuò)配堿基的DNA分子中使正常核苷酸序列恢復(fù)的修復(fù)方式。這種修復(fù)方式的特點(diǎn)是:識(shí)別出正確的鏈,切除掉不正確鏈的部分,然后通過(guò)DNA聚合酶和DNA連接酶的作用合成正確配對(duì)的雙鏈DNA.遺傳學(xué)中心法則(genetic central dogma):
描述從一個(gè)基因到相應(yīng)蛋白質(zhì)的信息流的途徑。遺傳信息貯存在DNA中,DNA被復(fù)制傳給子代細(xì)胞,信息被拷貝或由DNA被轉(zhuǎn)錄成RNA,然后RNA被翻譯成多肽鏈。不過(guò)由于逆轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn),也可以以RNA為模板合成DNA.轉(zhuǎn)錄(transcription):
在由RNA聚合酶和輔助因子組成的轉(zhuǎn)錄復(fù)合體的催化下,從雙鏈DNA分子中拷貝生物信息生成單一一條RNA鏈的過(guò)程。
模板鏈(template strand):
可作為模板轉(zhuǎn)錄為RNA的那條鏈,該鏈與轉(zhuǎn)錄的RNA堿基互補(bǔ)(A-U, G-C)。在轉(zhuǎn)錄過(guò)程中,RNA聚合酶與模板鏈結(jié)合,并沿著模板鏈的3ˊ→5ˊ方向移動(dòng),按照5ˊ→3ˊ方向催化RNA的合成。
編碼鏈(coding strand):
雙鏈DNA中,不能進(jìn)行轉(zhuǎn)錄的那條DNA鏈,該鏈的核苷酸序列與轉(zhuǎn)錄生成的RNA的序列一致(在RNA中是以U取代了DNA中的T)。
核心酶(core enzyme):
大腸桿菌的RNA聚合酶全酶由五個(gè)亞基(α2ββ‘δ)組成,沒有δ亞基的酶叫核心酶。核心酶只能使已開始合成的RNA鏈延長(zhǎng),但不具有起始合成RNA的能力,必需加入δ亞基才表現(xiàn)出全部聚合酶的活性。
RNA聚合酶(RNA polymerase):
以一條DNA鏈或RNA為模板催化由核苷-5ˊ-三磷酸合成RNA的酶。
啟動(dòng)子(promoter)NA分子中RNA聚合酶能夠結(jié)合并導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄起始的序列。
內(nèi)含子(introns):
在轉(zhuǎn)錄后的加工中,從最初的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物除去的內(nèi)部的核苷酸序列。術(shù)語(yǔ)內(nèi)含子也指編碼相應(yīng)RNA內(nèi)含子的DNA中的區(qū)域。
外顯子(exons):
既存在于最初的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。術(shù)語(yǔ)外顯子也指編碼相應(yīng)RNA外顯子的DNA中的區(qū)域。
終止因子(termination factors):
協(xié)助RNA 聚合酶識(shí)別終止信號(hào)的輔助因子(蛋白質(zhì))。
核酶(ribozymes):具有象酶那樣催化功能的RNA分子。
剪接體(spliceosome):
大的蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合體,它催化內(nèi)含子從mRNA前體中除去的反應(yīng)。
RNA加工過(guò)程(RNA processing):
將一個(gè)RNA原初轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物轉(zhuǎn)換成成熟RNA分子的反應(yīng)過(guò)程。加工包括從原初轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中刪除一些核苷酸,添加一些基因沒有編碼的核苷酸,和對(duì)某些堿基進(jìn)行共價(jià)修飾。
RNA剪接(RNA splicing):
從DNA模板鏈轉(zhuǎn)錄出的最初轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中除去內(nèi)含子,并將外顯子連接起來(lái)形成一個(gè)連續(xù)的RNA分子的過(guò)程。
翻譯(translation):
在蛋白質(zhì)合成期間將存在于mRNA上代表一個(gè)多肽鏈的核苷酸殘基序列轉(zhuǎn)換為多肽鏈氨基酸殘基序列的過(guò)程。
遺傳密碼(genetic code):
核酸中的核苷酸殘基序列與蛋白質(zhì)中的氨基酸殘基序列之間的對(duì)應(yīng)關(guān)系。連續(xù)的3個(gè)核苷酸殘基序列為一個(gè)密碼,特指一個(gè)氨基酸。標(biāo)準(zhǔn)的遺傳密碼是由64個(gè)密碼組成的,幾乎為所有生物通用。
起始密碼(iniation codon):
指定蛋白質(zhì)合成起始位點(diǎn)的密碼。最常見的起始密碼是蛋氨酸密碼:AUG.終止密碼(termination codon):
任何tRNA分子都不能正常識(shí)別的、但可被特殊蛋白結(jié)合并引起新合成的肽鏈從翻譯機(jī)器上釋放的密碼。存在三個(gè)終止密碼:UAG,UAA和UGA.密碼子(codon):
mRNA(或DNA)上的三聯(lián)體核苷酸殘基序列,該序列編碼著一個(gè)指定的氨基酸,tRNA的反密碼子與mRNA的密碼子互補(bǔ)。
反密碼子(anticodon):
tRNA分子的反密碼環(huán)上的三聯(lián)體核苷酸殘基序列。在翻譯期間,反密碼與mRNA中的互補(bǔ)密碼結(jié)合。
簡(jiǎn)并密碼子(degenerate codon):
也稱之同義密碼子(synonymous codon)。是指編碼相同氨基酸的幾個(gè)不同的密碼子。
氨基酸臂(amino arm):
也稱之接納莖(acceptor stem)。tRNA分子中靠近3ˊ端的核苷酸序列和5ˊ端的序列堿基配對(duì),形成的可接收氨基酸的臂(莖)。
TψC臂(TψC arm):
tRNA中含有胸腺嘧啶核苷酸-假尿嘧啶核苷酸-胞嘧啶核苷酸殘基序列的莖環(huán)結(jié)構(gòu)。
氨酰-tRNA(aminoacyl-tRNA):
在氨基酸臂的3ˊ端的腺苷酸殘基共價(jià)連接了氨基酸的tRNA分子。
同工tRNA(isoacceptor tRNA):結(jié)合相同氨基酸的不同的tRNA分子。
擺動(dòng)(wobble) :
處于密碼子3ˊ端的堿基和與之互補(bǔ)的反密碼的5ˊ端的堿基之間的堿基配對(duì)有一定的寬容性,即處于反密碼的5ˊ端的堿基(也稱之?dāng)[動(dòng)位置),例如I可以與密碼子上3ˊ端的U、C和A配對(duì)。由于存在擺動(dòng)現(xiàn)象所以使得一個(gè)tRNA反密碼子可以和一個(gè)以上的mRNA密碼子結(jié)合。
氨酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase):
催化特定氨基酸激活并共價(jià)結(jié)合在相應(yīng)的tRNA分子3ˊ端的酶。
翻譯起始復(fù)合體(translation initiation complex):
由核糖體亞基、一個(gè)mRNA模板、一個(gè)起始的tRNA分子和起始因子組成并組裝在蛋白質(zhì)合成起始點(diǎn)的復(fù)合體。
讀碼框( reading frame):
代表一個(gè)氨基酸序列的mRNA分子的非重疊密碼序列。一個(gè)mRNA的讀碼框是由轉(zhuǎn)錄起始位置(通常是AUG密碼)確定的。
SD序列(Shine-Dalgarno sequence):mRNA中用于結(jié)合原核生物核糖體的序列。
肽酰轉(zhuǎn)移酶(peptidyl transferase):
蛋白質(zhì)合成期間負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)移肽酰基和催化肽鍵形成的酶。
嘌呤霉素(puromycin):
通過(guò)整合到生長(zhǎng)著的肽鏈,引起肽鏈合成提前終止來(lái)抑制多肽鏈合成的一種抗生素。
開放讀碼框(open reading frame):
DNA 或RNA序列中一段不含終止密碼的連續(xù)的非重疊核苷酸密碼。
信號(hào)肽(signal peptide):
常指新合成多肽鏈中用于指導(dǎo)蛋白質(zhì)跨膜轉(zhuǎn)移(定位)的N-末端的氨基酸序列(有時(shí)不一定在N端)。
轉(zhuǎn)錄因子(transcription factor):
在轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合體的組裝過(guò)程中,與啟動(dòng)子區(qū)結(jié)合并與RNA聚合酶相互作用的一種蛋白質(zhì)。某些轉(zhuǎn)錄因子在RNA延伸時(shí)一直維持著結(jié)合狀態(tài)。
操縱子(operons):
是由一個(gè)或多個(gè)相關(guān)基因以及調(diào)控它們轉(zhuǎn)錄的操縱基因和啟動(dòng)子序列組成的基因表達(dá)單位。
操縱基因(operator):
與特定阻遏蛋白相互作用調(diào)控一個(gè)基因或一組基因表達(dá)的DNA區(qū)。
結(jié)構(gòu)基因(structural gene):編碼一個(gè)蛋白質(zhì)或一個(gè)RNA的基因。
轉(zhuǎn)錄激活劑(transcriptional activator):
通過(guò)增加RNA聚合酶的活性來(lái)加快轉(zhuǎn)錄速度的一種調(diào)節(jié)DNA結(jié)合蛋白。
阻遏物(repressor):
與一個(gè)基因的調(diào)控序列或操縱基因結(jié)合以阻止該基因轉(zhuǎn)錄的一類蛋白質(zhì)。
衰減作用(attenuation):
一種翻譯調(diào)控機(jī)制。在該機(jī)制中,核糖體沿著mRNA分子的移動(dòng)的速率決定轉(zhuǎn)錄是進(jìn)行還是終止。
亮氨酸拉鏈(leucine zipper):
出現(xiàn)在DNA結(jié)合蛋白質(zhì)和其它蛋白質(zhì)中的一種結(jié)構(gòu)基元(motif)。當(dāng)來(lái)自同一個(gè)或不同多肽鏈的兩個(gè)兩性的α-螺旋的疏水面(常常含有亮氨酸殘基)相互作用形成一個(gè)圈對(duì)圈的二聚體結(jié)構(gòu)時(shí)就形成了亮氨酸拉鏈。
鋅指(zinc finger):
也是一種常出現(xiàn)在DNA結(jié)合蛋白質(zhì)中的一種結(jié)構(gòu)基元。是由一個(gè)含有大約30個(gè)氨基酸殘基的環(huán)和一個(gè)與環(huán)上的4個(gè)Cys或2個(gè)Cys和2個(gè)His配位的Zn2+構(gòu)成,形成的結(jié)構(gòu)象個(gè)手指狀。
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